解析基因組三維結(jié)構(gòu)新獲一高質(zhì)量低成本研究方法
4月26日,我校曹罡課題組與李國(guó)亮課題組在國(guó)際著名期刊NatureGenetics聯(lián)合發(fā)表題為“Digestion-ligation-onlyHi-Cisanefficientandcost-ef-fectivemethodforchromosomeconformationcapture”的研究論文。該論文介紹了一種新染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)(DLOHi-C),為解析基因組三維結(jié)構(gòu)提供了一種新型高效、經(jīng)濟(jì)的研究方法。我校動(dòng)科動(dòng)醫(yī)學(xué)院博士生林達(dá)與信息學(xué)院博士生洪萍為論文的共同第一作者,動(dòng)科動(dòng)醫(yī)學(xué)院曹罡教授與信息學(xué)院李國(guó)亮教授為論文的共同通訊作者。
基因編碼區(qū)在基因組序列中只占極少部分。近年來研究表明其余“基因組垃圾序列”在基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中發(fā)揮著重要的調(diào)控功能。對(duì)染色質(zhì)構(gòu)象和三維基因組學(xué)的研究可以將基因組上原本分散的遠(yuǎn)距離調(diào)控元件與其具體調(diào)控區(qū)域更好的關(guān)聯(lián)起來,對(duì)理解基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控、增強(qiáng)子與啟動(dòng)子的相互作用、疾病易感位點(diǎn)、DNA損傷修復(fù)、基因組結(jié)構(gòu)變異和表觀遺傳有著重要的意義。