“十一五”時期，化學與化工系全體教工解放思想，與時俱進，開拓創(chuàng)新，在師資、教學、科研、就業(yè)等各方面工作都上了一個新臺階。
　　師資隊伍建設：化學與化工系現(xiàn)有教師46人，其中教授4人，副教授14人，博士8人，碩士22人；國家級突出貢獻專家2人，山東省專業(yè)技術(shù)拔尖人才1人，菏澤市專業(yè)技術(shù)拔尖人才1人，1人享受國務院特殊津貼，2人享受地方政府特殊津貼，2人獲曾憲梓教育基金獎，1人任山東省化學化工學會物理化學專業(yè)委員會副主任，1人任山東省化學化工學會無機化學專業(yè)委員會副主任。3位教師獲校級專業(yè)教學“青年教師教學大獎賽”三等獎，2位老師被評為校級教學名師，1位老師被評為?！拔倚哪恐惺褍?yōu)秀教師”。
　　學科專業(yè)建設：化學與化工系現(xiàn)有化學、化學工程與工藝、環(huán)境科學與工程（已列入山東省第一批企校共建工科專業(yè)）三個本科專業(yè)和化學教育、應用化工技術(shù)兩個?？茖I(yè)，“十一五”期間新增環(huán)境科學與工程一個本科專業(yè)。
　　《物理化學》《有機化學》《分析化學及實驗》課程均為在建的校級精品課程；物理化學和分析化學為學校重點建設學科；化學工程與工藝特色專業(yè)教學團隊為校級優(yōu)秀教學團隊。
　　設有基礎化學實驗室9個，化工專業(yè)實驗室4個，環(huán)境化學實驗室1個，精密儀器分析實驗室8個，應用化學研究所1個，科研開發(fā)室5個，菏澤學院首批重點實驗室1個，正在籌建煤化工研究所和化工單元實訓室。擁有高效液質(zhì)聯(lián)用儀、高效液相色譜儀等十多臺精密儀器，儀器設備總值800余萬元。2010年，爭取中央財政支持地方高校發(fā)展基金530萬元，建設煤化工技術(shù)研究與開發(fā)中心。
　　人才培養(yǎng)：2009年首屆考研學生被錄取52人，其中30名學生被“211”和“985”工程院校錄取；2010年考研錄取 92人，其中 58人被 “211”和“985”工程院校錄取，1人被中國科學院錄取。2009年山東省首屆大學生化學實驗技能競賽獲得 1個一等獎、2個三等獎；2010年山東省第二屆大學生化學實驗技能競賽獲得 1個二等獎、2個三等獎；2010年山東省首屆大學生化工過程實驗技能競賽獲得1個三等獎、1個優(yōu)秀獎；2009年全國大學生英語競賽獲得1個二等獎。
　　教學科研工作：“十一五”期間，化學與化工系教師公開發(fā)表研究論文300余篇，合作出版專著、教材等10部，其中80余篇論文獲得校級以上優(yōu)秀科研成果獎，被 SCI收錄論文 38篇。先后爭取國家星火計劃項目1項、“863”計劃項目2項，省科技廳攻關(guān)課題6項，省教育廳科研課題8項，獲得研究經(jīng)費400余萬元，目前在研科研課題20余項。在已通過專家鑒定的科研成果中，一項國際先進、四項國內(nèi)領(lǐng)先、三項國內(nèi)先進、一項獲第五屆亞太博覽會銀獎并獲山東省新產(chǎn)品樣品樣本展覽會特等獎、一項獲菏澤市科技進步一等獎、兩項獲菏澤市科技進步二等獎、七項獲國家專利。有五項已轉(zhuǎn)化為生產(chǎn)力，獲得了良好的經(jīng)濟效益和社會效益。
　　學術(shù)活動：曾先后邀請中科院院士錢逸泰教授、中科院院士宋振騏教授、中科院院士佟振合教授、中科院蘭州化學物理研究所博士生導師汪漢卿教授、山東大學化學化工學院博士生導師孫思修教授、香港中文大學嚴以京教授、北京化工大學張澤亭教授等來校作學術(shù)報告，2010年，邀請到美國新澤西州蒙特克萊爾大學化學與生物系主任馬克·埃森納教授和侯時鋒博士來校講學。成功舉辦了山東省化學化工學會無機化學專業(yè)委員會會議、山東省化學化工學會物理化學專業(yè)委員會會議、山東省高校化學化工學院（系）院長（主任）會議等重要學術(shù)會議，并積極參加全國和山東省各級學術(shù)會議。
　　校企共建：2009年與山東尚舜化工股份公司合作申報的市科技局立項的精細硅化工課題 《雙-3-三甲氧基硅丙基四硫化物的合成與應用》已完成實驗室研制，現(xiàn)已進入中試放大階段。與多家化工企業(yè)橫向合作，就員工培訓、傳統(tǒng)工藝技術(shù)改進、新技術(shù)研發(fā)、課題申報、教學實習等方面達成初步協(xié)作意向。