毛白楊基因組序列框架圖繪制完成
●本報訊 我國林木基因組學研究取得突破。北京林業(yè)大學的科學家選用百年古樹作為測序的樣本,利用最新的全基因組鳥槍法測序和拼接策略,繪制完成了毛白楊的基因組序列圖譜,標志著毛白楊分子育種進入基因組時代。
在“985”平臺建設資金支持下,北林大林木育種國家工程實驗室的專家們用短短的6個月完成了這一開創(chuàng)性的研究。
專家解釋說,基因組學研究成果在育種中應用后,將拓展野生種質資源中優(yōu)異等位基因挖掘的廣度和深度,顯著提高復雜性狀改良的可操作性和新品種選育的效率,對于保障我國森林資源可持續(xù)發(fā)展有十分重要的意義。
據(jù)悉,基因組學是現(xiàn)代植物研究的熱點。目前,水稻、高粱、玉米、大豆、黃瓜已完成全基因組測序,棉花、苜蓿、番茄和煙草等全基因組測序也全面展開。北林大完成繪制完成的毛白楊基因組序列圖譜開創(chuàng)了我國林業(yè)基因組學研究的先河。
科學家告訴記者,之所以選擇毛白楊作為我國林木基因組學研究的突破口,是因它為我國重要的鄉(xiāng)土樹種和造林綠化中廣泛采用的速生用材樹種;我國擁有豐富的毛白楊遺傳資源,其遺傳育種的研究基礎較強。
據(jù)悉,科學家完成的毛白楊基因組大小約為6億個堿基對,重疊群的平均長度為39.7Kb,達到了框架圖標準 (基因組常染色質區(qū)覆蓋度達到90%以上,基因區(qū)覆蓋度達到95%以上,單堿基的錯誤率達到1萬分之一以內)。科學家將在此基礎上進一步完善基因組序列圖譜,構建物理圖譜和高密度連鎖圖譜,實現(xiàn)基因組序列圖譜與物理圖譜、連鎖圖譜的整合,繪制出毛白楊基因組精細圖譜,以保證基因組序列組裝和基因注釋的準確性。
國際同行專家高度評價這樣一項重大研究。他們認為,毛白楊基因組的注釋和分析大大便利了科學家發(fā)現(xiàn)經濟性狀相關基因,使經濟性狀的遺傳圖譜定位,跨越到基因組圖譜和功能基因的精確定位,標志著毛白楊分子育種等相關研究正式進入基因組時代,將推動毛白楊育種技術的全面進步。毛白楊基因組序列測序完成,對木本植物發(fā)育的分子機制的了解、木本植物在進化歷程中地位的研究、可再生能源利用的研究具有重要的意義。(鐵錚)