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施一公研究組在《自然》發(fā)文為研究大腸桿菌抗酸機制提供重要線索



圖為該項研究成果所揭示的大腸桿菌谷氨酸:γ-氨基丁酸(GABA)反向轉(zhuǎn)運蛋白(GadC)的晶體結(jié)構(gòu)


  本報訊 3月11日,我校生命科學(xué)學(xué)院施一公教授研究組在國際頂尖學(xué)術(shù)期刊《自然》在線發(fā)表題為 《谷氨酸:γ-氨基丁酸反向轉(zhuǎn)運蛋白的結(jié)構(gòu)與功能機理》(Struc鄄tureandmechanismofaglutamate-GABA an鄄tiporter)的科研論文,報道了大腸桿菌谷氨酸:γ-氨基丁酸(GABA)反向轉(zhuǎn)運蛋白(GadC)的晶體結(jié)構(gòu),并結(jié)合生化實驗提出了 GadC轉(zhuǎn)運底物的可能機制。
  2011年在歐洲爆發(fā)的腸溶血性大腸桿菌疫情導(dǎo)致數(shù)千人感染,多人死亡,并引起了極大的社會恐慌。大腸桿菌O104:H4菌株是這一疫情的罪魁禍?zhǔn)?。食物來源的大腸桿菌必須通過極酸的胃環(huán)境(pH~2)才能到達(dá)腸道,為了保證在如此低的pH下仍然能夠存活,大腸桿菌進(jìn)化出了多個抗酸系統(tǒng)來對抗極酸環(huán)境。因此研究大腸桿菌抗酸機制對人類健康有直接的重要意義。
  大腸桿菌抗酸系統(tǒng)II(AcidResistancesystem2)通過谷氨酸:γ-氨基丁酸反向轉(zhuǎn)運蛋白 (GadC)將細(xì)胞外的谷氨酸轉(zhuǎn)運到細(xì)胞內(nèi),在胞漿內(nèi)谷氨酸發(fā)生脫羧反應(yīng),消耗一個質(zhì)子生成γ-氨基丁酸,而產(chǎn)物γ-氨基丁酸再被GadC轉(zhuǎn)運到細(xì)胞外。整個過程相當(dāng)于向細(xì)胞外排出一個質(zhì)子,降低了細(xì)胞內(nèi)的質(zhì)子濃度,從而起到了抗酸的作用。理解GadC的工作機理對于研究腸道致病菌抗酸系統(tǒng)十分關(guān)鍵。從GadC的三維空間結(jié)構(gòu)信息入手,施一公研究組解析了大腸桿菌 GadC高分辨率的晶體結(jié)構(gòu)。結(jié)構(gòu)分析表明,含有12個跨膜螺旋的GadC在pH堿性條件下呈現(xiàn)出轉(zhuǎn)運通道開口朝向胞內(nèi)的構(gòu)象,令人驚奇的是,GadC羧基端結(jié)構(gòu)域在細(xì)胞內(nèi)一側(cè)像塞子一樣將轉(zhuǎn)運通道封閉住。同時進(jìn)一步的生化實驗表明,GadC對底物的轉(zhuǎn)運嚴(yán)格依賴于環(huán)境pH值:野生型GadC在pH小于6.5的環(huán)境下才具有轉(zhuǎn)運能力,而在pH大于6.5的環(huán)境中完全沒有活性。羧基端“塞子”結(jié)構(gòu)域在GadC感受pH的過程中起到了重要的調(diào)節(jié)作用。這樣一種機制既保證了抗酸系統(tǒng)在極酸環(huán)境中能夠啟動并轉(zhuǎn)運底物,又防止其在正常生理條件下造成胞內(nèi)質(zhì)子不必要的外流。
  以上研究成果為進(jìn)一步研究大腸桿菌抗酸機制提供了重要線索。這是施一公研究組繼2009年、2010年報道Arginine:Agmatine反向轉(zhuǎn)運蛋白AdiC的結(jié)構(gòu)與機理之后,在腸道細(xì)菌抗酸性研究中的又一重要成果。(生命學(xué)院)